輔大生物學系自民國九十年八月一日起正式更名為生命科學系。本系前身之生物學，係由奧地利籍扈伯爾神父募款籌辦，成立於民國五十三年，扈伯爾神父亦擔任本系首任系主任，強調教學與研究並重，並建立良好之師生關係。本系自扈伯爾神父以來，一直積極參與各項研究及教學改進計畫，逐年購置實驗及教學相關儀器與設備，可從事各項先進之生物相關研究及教學。

扈神父於民國七十年退休，民國七十一年由第一屆系友劉寶瑋博士接任系主任，延續系務的發展，七十七年則由第四屆系友楊美桂博士主持系務，八十三年由陳擎霞主任接任，八十九年第十屆曾婉芳博士接任後，九十年交由第十一屆崔文慧系友接任，九十二年增班，九十六年由李永安教授擔任主任，九十九學年度起由第十五屆系友郭育綺教授接棒，100學年度由李永安教授擔任代理主任，101學年度起由蘇睿智博士擔任系主任。107學年度起由呂誌翼博士擔任系主任。113學年度起由侯藹玲博士擔任系主任。

本系自民國九十年八月一日起，由生物學系更名為生命科學系。

目標一：規劃完善的課程內容，使學生具有生命科學專業知識及解決問題的科學方法與精神。
1-1. 延聘生命科學各領域中，學有專精人士，擔任本系專任教師，負責開授相關課程，並從事相關之研究工作。
1-2. 建立完善的課程架構，使學生以普通生物學做為基礎，再分別進入動物、植物、微生物、及生態等專業，並由個體、細胞、再進入分子層次，以探討各種生命現象的基本機制。
1-3. 開設各種選修課程，使學生可依所興趣的領域，加強對該領域相關課程的了解。
1-4. 開設「專題討論」及「論文選讀」課程，以訓練學生搜集學術報告，並經由對報告閱讀、分析、及口頭報告，以訓練學生的問題分析、實驗設計、結果判讀、及表達等能力。
1-5. 經由「專業倫理」課程，使學生了解科技發展中，將面臨的道德考量及因應的方法。
1-6. 依據生命科學的進展，由本系專任教師或延聘兼任教師加開選修課程，以使學生掌握生命科學的新研究趨勢。
1-7. 配合學校之「教學評量系統」，重視學生對課程的建議，做為教師改進教學內容及方式之參考，以增進學生的學習效果。
1-8. 要求學生閱讀英文書藉及報告，以加強學生英文閱讀能力。
1-9. 建立「生命科學學習網站」，以輔助學生學習。
1-10. 鼓勵學生攻讀輔系或雙學位，以具備第二專業領域。

目標二：建立優良的學生實驗及研究環境，使學生具有生命科學相關之實驗技術及研究分析能力。
2-1. 開設生命科學相關之實驗課程，並編撰實驗手冊，使學生實驗設計目的、原理、及結果之分析及判讀。
2-2. 添購學生實驗儀器設備，以符合各項實驗之要求，並使學生了解各儀器之原理、操作方法、及用途。
2-3. 開設「專題研究」課程，鼓勵學生至校內外實驗室，參與生命科學相關之專題研究。
2-4. 邀請校內外專家學者，舉辦專題演講或研討會，使學生瞭解生命科學各相關領域之研究進展及產業之發展動向。
2-5. 安排參觀校外生命科學相關之學術及產業機構，使學生瞭解各機構之研發重點，以提學生未來就業之參考。
2-6. 安排參觀校外生命科學相關之學術及產業機構，使學生瞭解各機構之研發重點，以提供學生未來就業之參考。

目標三：營造良好的師生互動及輔導環境，以協助學生克服學習困難，並輔導學生進行生涯規劃.
3-1.由導師負責大一新生之「大學入門」課程，使學生能認識導師，熟悉系上的課程規劃及學習環境，並了解學校各項輔導制度。
3-2.由導師利用班會及每週「導師時間」，加強與學生溝通，並進行學生個別會談及輔導，以協助學生克服學習困難，並輔導學生進行生涯規劃。
3-3.經由「學長姊輔導制度」，加強學生對課程及系務的了解。
3-4.針對特定課程，建立「輔導小老師制度」，由學長姊輔導學弟妺對該課程內容的學習。
3-5.邀請畢業系友回系演講，分享當時學習及目前就業發展之經驗，以供學生參考。
3-6.由「系學會」舉辦各項活動，如球類比賽、生韻獎、火鍋大會、迎新送舊、家族聚餐等等，以加強師生及學生彼此間的互動及情感，並增進學生的團隊合作能力。
3-7.經由「人生哲學」課程，及學校提供之各項演講與成長團體，使學生了認識生命的意義，學習尊重生命，以實現人生的理想。